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1月18日，《國家稅務總局關于修改企業所得稅年度納稅申報表(A類，2014年版)部分申報表的公告》(國家稅務總局公告2016年第3號，以下簡稱“3號公告”)發布，該公告的內容是修改《國家稅務總局關于發布〈中華人民共和國企業所得稅年度納稅申報表(A類，2014年版)〉的公告》(國家稅務總局公告2014年第63號)中的部分申報表及填表說明，因此可以視作根據2015年出臺和生效的一系列企業所得稅稅收優惠政策變化而出臺的匯算清繳具體操作辦法。
3號公告第三條規定：“在企業所得稅《所得減免優惠明細表》(A107020)第33行‘四、符合條件的技術轉讓項目’填報說明中，刪除‘全球獨占許可’”內容。刪除之后相關填表說明變成了“一個納稅年度內，居民企業將其擁有的專利技術···的所有權或5年以上(含5年)使用權轉讓取得的所得，不超過 500萬元的部分，免征企業所得稅;超過500萬元的部分，減半征收企業所得稅”。這一變更是根據《財政部、國家稅務總局關于將國家自主創新示范區有關稅收試點政策推廣到全國范圍實施的通知》(財稅[2015]116號)和《國家稅務總局關于許可使用權技術轉讓所得企業所得稅有關問題的公告》(國家稅務總局公告2015年第82號)做出的。
根據修改后的填表說明，技術轉讓企業所得稅稅收優惠范圍大幅擴張，使以下兩類技術轉讓所得得以享受稅收優惠：一是技術所有權人以非獨占許可使用方式轉讓技術產生的所得，由于從同一項技術所有權可以派生出無數項非獨占許可使用權，因此理論上技術所有權人可以無限制就授予同一技術的非獨占許可使用享受稅收優惠;二是取得非獨占許可使用權的企業再轉讓其使用權時產生的所得也可以享受稅收優惠。
在可以享受稅收優惠的技術類型方面和技術許可使用年限上，本項優惠政策沒有修改，對于以授予非獨占許可使用權方式轉讓技術的技術所有權人而言，授予非獨占許可使用權的最低年限要求為5年;對于已經取得非獨占許可使用權的企業再轉讓其使用權而言，轉讓時使用權剩余年限也不能少于5年，否則將不得享受稅收優惠。
例如A企業就一項技術授予B企業7年非獨占許可使用權，B企業在獲得此項使用權3年后將其轉讓給C企業，則轉讓的技術使用權剩余年限少于5年，因此B企業轉讓技術使用權所得不能享受稅收優惠。
納稅人在按照3號公告修改后的填表說明申報企業所得稅時還需要注意，根據修改技術轉讓稅收優惠政策的財稅〔2015〕116號文件和國家稅務總局公告 2015年第82號，新的稅收優惠政策生效起始時間為2015年10月1日。在10月1日之前如果發生技術轉讓事項，企業仍需按照原填表說明執行，即 2015年1月1日至9月30日之間，只有轉讓技術所有權和授予5年以上全球獨占許可使用權取得所得方能享受稅收優惠。
例如，A企業在2015年分別于9月30日前和10月1日后就同一項技術授予B、C5年以上非獨占許可使用權，分別取得取得技術轉讓所得1000萬元，則A企業在進行該年度所得稅匯算清繳時對這兩項轉讓所得應當分別處理：對于9月30日前因為授予非獨占許可使用權而產生的所得，不應計算所得減免額;對于10月1日后產生的同類所得，可以按照《企業所得稅法實施條例》第90條的規定，所得額中500萬元以下部分免征，500萬元以上部分減半征收，則A 企業技術轉讓所得中應調減應納稅所得額=500+(1000-500)*50%=750萬元。
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